Come si evince dalla definizione appena fornita, la tassonomia è una disciplina estremamente versatile, che può essere applicata a molti campi della conoscenza umana, in particolare in ambito scientifico. Dopotutto il bisogno di chiarezza e di ordine è vitale nelle scienze e in tutte le applicazioni del pensiero razionale: non a caso l'esempio per antonomasia è la tassonomia biologica, ossia i criteri con cui vengono classificati in una gerarchia tutti gli organismi, per risalire eventualmente alla loro evoluzione.
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